De Wet waardering onroerende zaken (Wet WOZ) regelt dat gemeenten ieder jaar de waarde van onroerende zaken, zoals woningen en bedrijven, vaststellen. Waterschappen gebruiken de WOZ-waarde voor de watersysteemheffing gebouwd. De uitvoering door de gemeenten moet doelmatig en effectief binnen de kaders van de wet plaatsvinden.

De Unie van Waterschappen maakt deel uit van het bestuur van de Waarderingskamer. De Waarderingskamer controleert of gemeenten de wet goed uitvoeren. Verder zijn er medewerkers van de Unie van Waterschappen als leden actief in verschillende permanente commissies van de Waarderingskamer.

De Unie van Waterschappen is ook vertegenwoordigd in de periodieke WOZ-overleggen van het ministerie van Financiën.